Untuk mewujudkan misi tersebut, HCU memiliki tujuan sebagai berikut :

1. Mengupayakan terwujudnya penelitian yang mendukung pelaksanaan produk halal di bidang pangan, kesehatan dan barang gunaan
2. Mengupayakan terwujudnya pengabdian kepada masyarakat berupa edukasi halal

• dan menumbuhkan kesadaran masyarakat untuk senantiasa mengkonsumsi produk halal
• Menyediakan informasi tentang produk halal dari berbagai aspek secara menyeluruh
• Menyelenggarakan kolaborasi antar ilmuwan dan laboratorium terkait status halal pada produk pangan, kesehatan dan barang gunaan
• Memberikan pendampingan bagi industri kecil dan menengah dalam menghasilkan produk halal
• Menyelenggarakan pelatihan halal untuk industri, akademisi dan masyarakat umum
• Menginisiasi terbentuknya lembaga penjaminan halal di Unesa